Non, au contraire du système de tout à l’égout qui disperse les germes dangereux dans l’eau. Il faut cependant appliquer les précautions d’usage lors des manipulations (éventuellement le port de gants et de toute façon le lavage des mains) et éviter que les enfants et les animaux aient accès au compost avant complète maturation (deux ans). Il faut également appliquer le bon sens du maraîcher avant la réintroduction du compost dans les cycles agricoles.